Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms