Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm21060J3KMU4 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms