Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Gm28048F7BCN0 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Gm28048F7BCN0 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Gm28048F7BCN0 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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