Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Rims2-205ENSMUST00000227243 4760 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Luc7l-202ENSMUST00000114976 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Flnb-201ENSMUST00000052678 9100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Mtf1-201ENSMUST00000030723 7631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Synj2-209ENSMUST00000115790 4808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Mars2-201ENSMUST00000061334 11294 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Baz2a-208ENSMUST00000220049 8443 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Prpf4-201ENSMUST00000084524 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Atp2b2-202ENSMUST00000101044 4586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Wipf3-206ENSMUST00000172046 4204 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Chid1-209ENSMUST00000166082 4222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sfta2E9PXB6 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms