Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms