Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms