Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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