Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ambra1A2AH22 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ambra1A2AH22 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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