Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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