Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Pdpk1Q9Z2A0 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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Pdpk1Q9Z2A0 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Pdpk1Q9Z2A0 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Pdpk1Q9Z2A0 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Pdpk1Q9Z2A0 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Pdpk1Q9Z2A0 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Pdpk1Q9Z2A0 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Pdpk1Q9Z2A0 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Pdpk1Q9Z2A0 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Pdpk1Q9Z2A0 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
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