Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC4

Sorcs1, VPS10 domain-containing receptor SorCS1, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorcs1Q9JLC4 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sorcs1Q9JLC4 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms