Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Hmgn5Q9JL35 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Hmgn5Q9JL35 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Hmgn5Q9JL35 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Hmgn5Q9JL35 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Hmgn5Q9JL35 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Hmgn5Q9JL35 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hmgn5Q9JL35 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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