Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

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Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 AC163638.2-201ENSMUST00000224920 827 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
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Rb1cc1Q9ESK9 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Rasgrp1-204ENSMUST00000173252 1750 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rb1cc1Q9ESK9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rb1cc1Q9ESK9 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Rb1cc1Q9ESK9 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rb1cc1Q9ESK9 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rb1cc1Q9ESK9 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rb1cc1Q9ESK9 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rb1cc1Q9ESK9 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rb1cc1Q9ESK9 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rb1cc1Q9ESK9 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rb1cc1Q9ESK9 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rb1cc1Q9ESK9 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rb1cc1Q9ESK9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rb1cc1Q9ESK9 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rb1cc1Q9ESK9 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rb1cc1Q9ESK9 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rb1cc1Q9ESK9 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rb1cc1Q9ESK9 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rb1cc1Q9ESK9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rb1cc1Q9ESK9 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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