Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Usp29Q9ES63 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
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Usp29Q9ES63 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Usp29Q9ES63 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Usp29Q9ES63 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Usp29Q9ES63 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Usp29Q9ES63 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Usp29Q9ES63 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Usp29Q9ES63 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Usp29Q9ES63 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Usp29Q9ES63 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Usp29Q9ES63 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Usp29Q9ES63 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms