Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

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Length 537 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 Gm8356-202ENSMUST00000164917 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Ear1-202ENSMUST00000179200 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm27155-201ENSMUST00000183716 898 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm43693-201ENSMUST00000196072 1249 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Olfr1086-201ENSMUST00000099878 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Olfr353-202ENSMUST00000215925 1615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm14415-201ENSMUST00000118260 1578 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm14848-201ENSMUST00000121850 467 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm19066-201ENSMUST00000193232 1078 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm40418-201ENSMUST00000218806 1013 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 AC126275.1-201ENSMUST00000224881 446 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Tas2r134-201ENSMUST00000070028 898 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm8676-201ENSMUST00000184206 637 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm43761-201ENSMUST00000202132 991 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm5307-201ENSMUST00000204772 760 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm20274-201ENSMUST00000206967 584 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Pah-204ENSMUST00000219813 789 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms