Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC61

Pmpca, Mitochondrial-processing peptidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcaQ9DC61 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PmpcaQ9DC61 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PmpcaQ9DC61 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PmpcaQ9DC61 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PmpcaQ9DC61 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PmpcaQ9DC61 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PmpcaQ9DC61 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.7 ms