Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
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