Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
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Ccdc97Q9DBT3 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Lpin3-201ENSMUST00000040872 3458 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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