Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms