Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms