Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Trappc6bQ9D289 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Trappc6bQ9D289 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Trappc6bQ9D289 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Trappc6bQ9D289 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Trappc6bQ9D289 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Trappc6bQ9D289 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Trappc6bQ9D289 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Trappc6bQ9D289 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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