Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Zbed3Q9D0L1 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Zbed3Q9D0L1 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Zbed3Q9D0L1 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Zbed3Q9D0L1 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Zbed3Q9D0L1 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Zbed3Q9D0L1 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Zbed3Q9D0L1 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Zbed3Q9D0L1 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Zbed3Q9D0L1 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Zbed3Q9D0L1 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Zbed3Q9D0L1 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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