Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F1

Ndc80, Kinetochore protein NDC80 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndc80Q9D0F1 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndc80Q9D0F1 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndc80Q9D0F1 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndc80Q9D0F1 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndc80Q9D0F1 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndc80Q9D0F1 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndc80Q9D0F1 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndc80Q9D0F1 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ndc80Q9D0F1 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ndc80Q9D0F1 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndc80Q9D0F1 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndc80Q9D0F1 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ndc80Q9D0F1 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndc80Q9D0F1 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ndc80Q9D0F1 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ndc80Q9D0F1 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ndc80Q9D0F1 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ndc80Q9D0F1 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Ndc80Q9D0F1 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ndc80Q9D0F1 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ndc80Q9D0F1 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndc80Q9D0F1 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ndc80Q9D0F1 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndc80Q9D0F1 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndc80Q9D0F1 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndc80Q9D0F1 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndc80Q9D0F1 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndc80Q9D0F1 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndc80Q9D0F1 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndc80Q9D0F1 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndc80Q9D0F1 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndc80Q9D0F1 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndc80Q9D0F1 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndc80Q9D0F1 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndc80Q9D0F1 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndc80Q9D0F1 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndc80Q9D0F1 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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