Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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