Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Prelid3bQ9CYY7 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms