Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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