Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWL8

Ctnnbl1, Beta-catenin-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbl1Q9CWL8 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ctnnbl1Q9CWL8 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms