Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm14862-201ENSMUST00000115553 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm21089-201ENSMUST00000215843 325 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Speer6-ps1-203ENSMUST00000223482 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Olfr834-201ENSMUST00000086492 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Samd13-204ENSMUST00000147113 729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm43569-201ENSMUST00000196200 559 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm44746-201ENSMUST00000205565 1349 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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