Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms