Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms