Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Bhlhe41Q99PV5 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms