Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GpnmbQ99P91 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GpnmbQ99P91 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GpnmbQ99P91 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GpnmbQ99P91 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GpnmbQ99P91 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GpnmbQ99P91 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GpnmbQ99P91 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GpnmbQ99P91 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GpnmbQ99P91 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GpnmbQ99P91 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GpnmbQ99P91 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GpnmbQ99P91 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
GpnmbQ99P91 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
GpnmbQ99P91 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GpnmbQ99P91 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GpnmbQ99P91 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GpnmbQ99P91 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GpnmbQ99P91 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
GpnmbQ99P91 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GpnmbQ99P91 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
GpnmbQ99P91 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GpnmbQ99P91 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GpnmbQ99P91 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GpnmbQ99P91 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GpnmbQ99P91 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GpnmbQ99P91 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GpnmbQ99P91 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GpnmbQ99P91 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GpnmbQ99P91 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GpnmbQ99P91 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GpnmbQ99P91 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GpnmbQ99P91 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GpnmbQ99P91 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GpnmbQ99P91 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms