Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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