Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms