Protein–RNA interactions for Protein: Q99J36

Thumpd1, THUMP domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd1Q99J36 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thumpd1Q99J36 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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