Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
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Smim11aQ99J19 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
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Smim11aQ99J19 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Smim11aQ99J19 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
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Smim11aQ99J19 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
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Smim11aQ99J19 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Smim11aQ99J19 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Smim11aQ99J19 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Smim11aQ99J19 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Smim11aQ99J19 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Smim11aQ99J19 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Smim11aQ99J19 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Smim11aQ99J19 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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