Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Slc8b1Q925Q3 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms