Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms