Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Znf628Q8CJ78 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Znf628Q8CJ78 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
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Znf628Q8CJ78 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
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Znf628Q8CJ78 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Znf628Q8CJ78 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Znf628Q8CJ78 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Znf628Q8CJ78 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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