Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rab11fip3Q8CHD8 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rab11fip3Q8CHD8 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Rab11fip3Q8CHD8 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Rab11fip3Q8CHD8 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Rab11fip3Q8CHD8 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rab11fip3Q8CHD8 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rab11fip3Q8CHD8 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rab11fip3Q8CHD8 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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