Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms