Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Znf428Q8C1M2 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf428Q8C1M2 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf428Q8C1M2 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf428Q8C1M2 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf428Q8C1M2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf428Q8C1M2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf428Q8C1M2 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf428Q8C1M2 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf428Q8C1M2 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf428Q8C1M2 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf428Q8C1M2 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf428Q8C1M2 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf428Q8C1M2 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf428Q8C1M2 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf428Q8C1M2 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf428Q8C1M2 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf428Q8C1M2 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf428Q8C1M2 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf428Q8C1M2 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf428Q8C1M2 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf428Q8C1M2 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf428Q8C1M2 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf428Q8C1M2 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf428Q8C1M2 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf428Q8C1M2 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf428Q8C1M2 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf428Q8C1M2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf428Q8C1M2 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf428Q8C1M2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf428Q8C1M2 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf428Q8C1M2 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf428Q8C1M2 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf428Q8C1M2 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf428Q8C1M2 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf428Q8C1M2 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf428Q8C1M2 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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