Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trim35Q8C006 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trim35Q8C006 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trim35Q8C006 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trim35Q8C006 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trim35Q8C006 Nr6a1os-202ENSMUST00000151229 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trim35Q8C006 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trim35Q8C006 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trim35Q8C006 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Trim35Q8C006 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Esp34-201ENSMUST00000173055 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm12955-201ENSMUST00000119689 957 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm13751-201ENSMUST00000120280 752 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm6373-201ENSMUST00000121026 360 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm16134-201ENSMUST00000161714 336 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm5501-201ENSMUST00000165917 832 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm10717-207ENSMUST00000179264 672 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms