Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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