Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms