Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC9□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC9□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Smim19Q80ZU4 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms