Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
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Ttc28Q80XJ3 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
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Ttc28Q80XJ3 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
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Ttc28Q80XJ3 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
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Ttc28Q80XJ3 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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Ttc28Q80XJ3 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
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Ttc28Q80XJ3 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ttc28Q80XJ3 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
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