Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SnupnQ80W37 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms