Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rexo1Q7TT28 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms