Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms